(1)凡符合以下報廢條件的不能用于臨床使用的醫療設備，應予以報廢。
經檢測，維修后技術性能仍無法達到臨床應用基本要求。
儀器設備老化，技術性能落后，超過使用年限。
嚴重污染環境，危害患者或工作人員安全及健康，改造費用昂貴的。
雖可以修復，但維修費用過大，已不值得修理的。
計量器具按“計量器具管理制度”規定，已無法滿足計量基本標準的要求。
凡是國家明文禁止使用的醫療器械及相關的設備
(2)申請報廢醫療（含教學、科研）設備，由使用部門提出，醫學工程部（處、科、室）登記造冊，逐一填寫“報廢醫療設備申請表”，有相關技術部門作技術鑒定，設備主管提出調劑報廢意見，財務部門辦理相關手續。
(3)萬元以上醫療（含教學、科研）設備的報廢，按國家國有資產管理局《行政事業單位國有資產處置管理實施辦法》的規定程序申報。
(4)凡減免稅進口的醫療（含教學、科研）設備，除以上規定外還應按海關有關規定辦理。對于可供家用設備的報廢處理，應加強審核，嚴格控制。
(5)待報廢醫療（含教學、科研）設備在未批復前應妥善保管，已批準的報廢的大型醫療設備應將其可利用部分拆下，折價入賬，入庫保管，合理利用。
(6)經批準報廢的醫療（含教學、科研）設備，使用部門和個人不得自行處理，一律交回設備主管部門統一處理。如有違反者應予追查，并交主管部門處理。
(7)已批準報廢的醫療（含教學、科研）設備在處理后，應及時辦理財務銷賬手續，其殘值收益應列入醫療設備更新費、改造基金項目專項使用。